Текст работы размещён без изображений и формул.
Полная версия работы доступна во вкладке «Файлы работы» в формате PDF
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой кислоты (ДНК) в биологическом материале (пробе). Помимо амплификации ДНК, ПЦР позволяет производить множество других манипуляций с нуклеиновыми кислотами (введение мутаций, сращивание фрагментов ДНК) и широко используется в биологической и медицинской практике, например, для диагностики заболеваний (наследственных, инфекционных), для установления отцовства, для клонирования генов, выделения новых генов [1].
Полимеразную цепную реакцию (ПЦР, PCR) изобрёл в 1983 году Кэри Мюллис (американский учёный). Впоследствии он получил за это изобретение Нобелевскую премию. В настоящее время ПЦР-диагностика является, одним из самых точных и чувствительных методов диагностики инфекционных заболеваний. ПЦР — метод молекулярной диагностики, ставший для ряда инфекций «золотым стандартом», проверен временем и тщательно апробирован клинически. Специфичность ПЦР при использовании технологии PCR даже для всех вирусных, хламидийных, микоплазменных, уреаплазменных и большинства других бактериальных инфекций достигает 100%. Метод ПЦР позволяет выявлять даже единичные клетки бактерий или вирусов. ПЦР-диагностика обнаруживает наличие возбудителей инфекционных заболеваний в тех случаях, когда другими методами (иммунологическими, бактериологическими, микроскопическими) это сделать невозможно. Особенно эффективен метод ПЦР для диагностики трудно культивируемых, некультивируемых и скрыто существующих форм микроорганизмов, с которыми часто приходится сталкиваться при латентных и хронических инфекциях, поскольку этот метод позволяет избежать сложностей, связанных с выращиванием таких микроорганизмов в лабораторных условиях. Специфичность ПЦР основана на образовании комплементарных комплексов между матрицей и праймерами — короткими синтетическими олигонуклеотидами длиной 18 — 30 букв. Каждый из праймеров сопоставим (комплементарен) с одной из цепей двуцепочечной матрицы, обрамляя начало и конец амплифицируемого участка. После соединения (гибридизации) матрицы с праймером (отжиг), последний служит затравкой для ДНК-полимеразы при синтезе комплементарной цепи матрицы [1].
Для проведения ПЦР в простейшем случае требуются следующие компоненты:
1.ДНК-матрица, содержащая тот участок ДНК, который требуется амплифицировать;
2.два праймера, комплементарные концам требуемого фрагмента;
3.термостабильная ДНК-полимераза;
дезоксинуклеотидтрифосфаты (A, G, C, T);
4.ионы Mg2+, необходимые для работы полимеразы;
5.буферный раствор.
ПЦР проводят в амплификаторе — приборе, обеспечивающем периодическое охлаждение и нагревание пробирок, обычно с точностью не менее 0,1°C. Чтобы избежать испарения реакционной смеси, в пробирку добавляют высококипящее масло, например, вазелиновое. Обычно при проведении ПЦР выполняется 20 — 35 циклов, каждый из которых состоит из трех стадий. Двухцепочечную ДНК-матрицу нагревают до 94 — 96°C (или до 98°C, если используется особенно термостабильная полимераза) на 0,5 — 2 минуты, чтобы цепи ДНК разошлись. Эта стадия называется денатурацией — разрушаются водородные связи между двумя цепями. Иногда перед первым циклом проводят предварительный прогрев реакционной смеси в течение 2 — 5 минут для полной денатурации матрицы и праймеров. Когда цепи разошлись, температуру понижают, чтобы праймеры могли связаться с одноцепочечной матрицей. Эта стадия называется отжигом. Температура отжига зависит от праймеров и обычно выбирается на 4 — 5°С ниже их температуры плавления. Время стадии — 0,5 — 2 минут. ДНК-полимераза реплицирует матричную цепь, используя праймер в качестве затравки. Это — стадия элонгации. Температура элонгации зависит от полимеразы. Часто используемые полимеразы наиболее активны при 72°C. Время элонгации зависит как от типа ДНК-полимеразы, так и от длины амплифицируемого фрагмента. Обычно время элонгации принимают равным одной минуте на каждую тысячу пар оснований. После окончания всех циклов часто проводят дополнительную стадию финальной элонгации, чтобы достроить все одноцепочечные фрагменты. Эта стадия длится 10 — 15 мин. Для успешного проведения анализа важно правильно собрать материал у пациента и правильно провести его подготовку. Известно, что в лабораторной диагностике большинство ошибок (до 70%) совершается именно на этапе пробоподготовки.
Требования к организации помещений для лаборатории ПЦР
Проведение исследований методом ПЦР допускается на базе действующих лабораторий при условии организации в лаборатории самостоятельных или выделенных в составе других функциональных помещений рабочих зон, соответствующих этапам ПЦР-анализа. ПЦР-лаборатория должна включать следующий минимальный набор рабочих зон:
1.Приема, регистрации, разбора и первичной обработки материала;
2.Выделения ДНК/РНК;
3.Приготовления реакционных смесей и проведения ПЦР;
4.Детекции продуктов амплификации методом электрофореза или ГиФА.
Важно отметить, что в случае применения метода ПЦР в режиме «реального времени» (real-time PCR) нет необходимости в детекции продуктов амплификации методом электрофореза. Следовательно, рабочую зону в помещении лаборатории для электрофореза можно не выделять.
В ПЦР-лабораториях необходимо также предусмотреть наличие вспомогательных помещений: архив (для учетных документов), комнату для персонала, кабинет заведующего, раздевалки для сотрудников, комнаты приема пищи, санитарных комнат (туалет), подсобных помещений (склад).
Помещения для выполнения работ на этапах ПЦР-анализа должны быть боксированными (боксы с предбоксами). Зону выделения ДНК/РНК размещают в отдельном помещении. При организации ПЦР-лаборатории на базе действующей лаборатории допускается выделение ДНК/РНК в помещениях, в которых проводят другие виды исследований. Помещение для приготовления реакционных смесей и проведения ПЦР должно быть отдельным. Приготовление реакционных ПЦР-смесей проводят в ПЦР-боксе. ПЦР-лабораторию оборудуют водопроводом, канализацией, электричеством и отоплением. Внутреннюю отделку помещений выполняют в соответствии с их функциональным назначением. Поверхности стен, пола и потолка в лабораторных помещениях должны быть гладкими, без щелей, легко обрабатываемыми, устойчивыми к действию моющих и дезинфицирующих средств. Полы не должны быть скользкими. Лабораторная мебель должна иметь покрытие, устойчивое к действию моющих и дезинфицирующих средств. Поверхность столов не должна иметь трещин и швов. Помещения лаборатории должны быть непроницаемы для грызунов и насекомых. ПЦР-лабораторию обеспечивают средствами пожаротушения. Бактерицидные лампы в помещениях ПЦР-лаборатории устанавливают из расчета 2,5 Вт/куб.м [2].
Работу с ПБА III — IV групп патогенности методом ПЦР проводят только при наличии в организации лицензии на деятельность, связанную с использованием возбудителей инфекционных заболеваний человека, и санитарно-эпидемиологического заключения о возможности проведения соответствующих работ в лаборатории, выданных в установленном порядке. Организацию работ на этапах приема, разбора и первичной обработки материала, подготовки проб и выделения нуклеиновых кислот, а также обеззараживания проб проводят в соответствии с требованиями СП 1.2.731-99 «Безопасность работы с микроорганизмами III — IV групп патогенности и гельминтами». Работу на остальных этапах ПЦР-анализа проводят, как с обеззараженным материалом. В лабораториях, имеющих санитарно-эпидемиологическое заключение о возможности проведения работ с ПБА III группы патогенности, допускается проведение исследований методом ПЦР (без предварительного накопления возбудителя) с целью диагностики бруцеллеза, парентеральных вирусных гепатитов, ВИЧ-инфекции, возбудители которых относятся ко II группе патогенности [2].
Не допускается проведение исследований методом ПЦР в помещениях, где осуществляют работы по накоплению ПБА и генно-инженерные работы. Работу с ПБА методом ПЦР выполняют специалисты с высшим и средним специальным образованием, прошедшие подготовку на лицензированных курсах специализации (повышения квалификации) по молекулярно-генетическим (ПЦР) методам диагностики. Персонал допускают к работе с ПБА только после проведения инструктажа по соблюдению требований биологической безопасности. В ПЦР-лаборатории, выполняющей работы с ПБА, используют дезинфицирующие средства, разрешенные к применению в установленном порядке. Каждое помещение для проведения исследований методом ПЦР оснащают индивидуальным набором соответствующего лабораторного оборудования, расходных материалов и одежды, используемых только в данном помещении. При проведении исследований методом ПЦР неукоснительно соблюдают следующие правила последовательной обработки материала. Весь поступающий материал направляют в комнату приема материала. Поступивший материал маркируют и регистрируют в специальном журнале. Первичную обработку материала (взятие, маркировка и центрифугирование проб и др.) проводят только в комнате приема биологического материала. В помещение выделения НК материал доставляют только в закрытых одноразовых пробирках в виде маркированных аликвот. Передачу и доставку аликвот проб обработанного и обеззараженного материала, а также пробирок с продуктами ПЦР из одного помещения в другое осуществляют в закрывающихся металлических или пластмассовых контейнерах. После проведения детекции и учета результатов исследования пробирки с продуктами ПЦР и использованные наконечники к микродозаторам подвергают первичной обработке дезинфицирующими растворами, вызывающими деградацию ДНК (например: 0,2 %-ный раствор ДП-2Т или другие, аналогичные ему, разрешенные к применению для этих целей в установленном порядке). Процедуру проводят непосредственно в комнате учета результатов амплификации. Окончательную дезактивацию использованных расходных материалов и реагентов (гель, буфер для электрофореза) производят в автоклавной комнате. Соблюдают поточность продвижения исследуемого материала и его производных (пробы ДНК или РНК, продукты ПЦР). Строго соблюдают условия хранения всех реагентов и образцов ДНК согласно инструкции к набору реагентов. Образцы ДНК хранят отдельно от реагентов. Не допускается использование реагентов с истекшим сроком годности или хранившихся в условиях, не соответствующих требованиям, изложенным в инструкциях. По окончании работы все объекты, содержащие ПБА, убирают в хранилища (холодильники, шкафы и т.д.), после чего рабочие поверхности в обязательном порядке подвергаются дезинфекции. Остатки ПБА и посуду, использованную на этапах приема, разбора и первичной обработки материала, подготовки проб и выделения нуклеиновых кислот, приготовления реакционных смесей и проведения ПЦР, собирают в закрывающиеся емкости и передают в автоклавную. Слив необеззараженных жидкостей в канализационную сеть не допускается. Перенос ПБА и использованной посуды для обеззараживания осуществляют в закрывающихся емкостях, исключающих инфицирование во время транспортирования. Во всех помещениях лаборатории регулярно проводят влажную уборку. Каждую рабочую зону ПЦР-анализа обеспечивают индивидуальным промаркированным набором уборочного инвентаря. Не допускается использовать уборочный инвентарь для уборки других помещений. Сотрудников каждой рабочей зоны обеспечивают спецодеждой: медицинским халатом, шапочкой, перчатками и сменной обувью. При работе в помещении детекции продуктов амплификации следует надевать бахилы. Перемещение одежды из зоны в зону категорически не допускается. Рекомендуется использование одноразовой одежды. Обработку рабочей одежды из зоны детекции продуктов амплификации проводят отдельно от одежды из других зон. Обеззараживание рабочей одежды проводят в соответствии с СП 1.2.731-99 «Безопасность работы с микроорганизмами III — IV групп патогенности и гельминтами». Лабораторию обеспечивают аптечкой стандартной комплектации для оказания первой медицинской помощи [2].
Библиографический список
1. Полимеразная цепная реакция [Электронный ресурс] — Москва,2017: https://ru.wikipedia.org/wiki/Полимеразная_цепная_реакция
2. Лабораторная диагностика. Требования к организации помещений для лаборатории ПЦР. [Электронный ресурс] Москва, 2013. Режим доступа: https://www.ld.ru/PCR/ilist-4338.html
Библиографическое описание:
ПЦР-лаборатории. — Текст : непосредственный // Молодой ученый. — 2018. — № 41 (227). — URL: https://moluch.ru/archive/227/66805/ (дата обращения: 22.03.2023).
Недорогой, но точный метод ДНК-диагностики востребован генной инженерией, палеонтологией, антропологией, сельским хозяйством и судебной медициной. Полимеразная цепная реакция в клинической медицине имеет много вариаций и целей, но применяется по большей части для выявления инфекционного возбудителя в генетическом материале – ДНК в виде генома, суспензии или частички молекулы.
Исследования
Все виды PCR проводят в клинико-диагностических лабораториях. С помощью ПЦР создают копии части ДНК из образца, значительно увеличив его концентрацию в пробе.
Посредством PCR-анализа обнаруживают:
- гепатит, вызываемый вирусами – B, C, D, G;
- инфекции урогенитальные/внутриутробные;
- половые, включая герпес- и папилломавирус, TORCH;
- инфекции органов дыхания и кишечника;
- гнойно-септические и нейроинфекции;
- оппортунистические.
Эффективность PCR-анализа обусловлена его способностью найти возбудителя до клинических признаков болезни, существенно ускорив диагностику и исключив ошибку.
Требования к лаборатории
Они указаны в нормативных документах, которые касаются помещений подобного типа. Например, приложение №16 к «Порядку оказания медпомощи в дерматовенерологии» (дополняющее Приказ №924 Минздрава РФ) описывает стандарты оборудования для лаборатории, действующей в кожно-венерологическом диспансере.
Рабочие зоны
Под разные стадии ПЦР-анализа отводятся свои зоны, и первой из них становится площадка, где производят первичную обработку материала. Здесь его принимают, регистрируют, сортируют, затем наносят маркировку и хранят. Кроме того, в лаборатории предусмотрены и другие основные зоны.
Выделение ДНК
Рекомендуется обустраивать эту зону обособленно, но при отсутствии свободной площади (не менее 15–20 кв. м.) возможно её совмещение с площадками, предназначенными для иных, за исключением генно-инженерных, целей. В этом случае оборудуют PCR-бокс только под полимеразную цепную реакцию.
Анализ и приготовление смесей
В этой комнате (площадью от 15 до 20 кв.м.) готовят реакционные смеси, а также отправляют в пробирку для PCR-анализа препараты ДНК, реже РНК. Лучше развести оба этапа по двум комнатам. Если это невозможно, для каждого из них оборудуют автономный бокс.
Детекция
Под неё приспосабливают обособленный отсек размером около 25–30 кв.м., где есть ПЦР-бокс. Для детекции применяют гибридизационный анализ с электрофорезом, отводя для каждого свои посуду и расходные материалы. При параллельном использовании обоих способов потребуется сектор, где делают только гибридизационный анализ. Место под детекцию не нужно, если в лаборатории освоен real-time PCR.
Дополнительные помещения
К ним относятся:
- архив, где хранится документация;
- гардероб, санузел;
- комнаты, где отдыхает/обедает персонал;
- складское помещение;
- кабинет заведующего.
Чтобы обеззаразить анализируемые фрагменты, потребуется обустроить автоклавную. При недостатке площадей её совмещают с одним из лабораторных подразделений.
Технические требования
ПЦР-лаборатория, обязана (наряду с регламентированным зонированием) иметь:
- водопровод с канализацией;
- кондиционеры;
- свет (естественный/искусственный);
- электричество с отоплением;
- вентиляцию;
- систему тушения пожара.
Следует исключить обмен воздухом между сектором детекции и прочими лабораторными секторами.
Отделка
Полы требуют противоскользящего покрытия (без стыков/зазоров), который выдерживает обработку химическими реагентами, в том числе дезинфицирующими жидкостями. Аналогичные требования предъявляют к потолку и стенам – они должны легко отмываться и не иметь трещин. Исполняя Указания по использованию бактерицидных ламп для обеззараживания воздуха/поверхности внутри помещений, во всех рабочих зонах монтируют бактерицидные облучатели, рассчитывая их мощность по метражу.
Оборудование и мебель
ПЦР-лабораторию оснащают системами для гель-электрофореза (отображающей результаты) и гель-документации (анализирующей эти результаты). В перечень включены как бытовой, так и низкотемпературный (до минус 80°С) холодильники, а также центрифуга-встряхиватель и центрифуга для пробирок.
Кроме того, необходимы устройства:
- амплификатор, насос с колбой-ловушкой;
- твердотельный термостат Eppendorf;
- трансиллюминатор, бокс (настольный) для ПЦР;
- прибор для электрофореза (горизонтального);
- устройство, считывающее результаты исследования на ДНК-чипах;
- камера для гибридизации;
- оборудование для ПЦР-анализа в реальном времени;
- комплекты пипеточных дозаторов (одно- и восьмиканальных).
В PCR-лаборатории ставят специальную мебель – стулья, столы рабочие, тумбы, стеллажи, шкафы (под посуду, документацию, материалы и не только). Лабораторная мебель должна быть не только эргономичной и долговечной, но и противостоять агрессивным, по преимуществу химическим, веществам.
Основные термины (генерируются автоматически): PCR, TORCH, зона, лаборатория, цепная реакция.
Оборудование для ПЦР лаборатории
07.10.2021
Современные ПЦР лаборатории специализируются на проведении диагностики ДНК/РНК посредством методик полимерной цепной реакции. Целью проводимых исследований выступает определение инфекций, присутствующих в организме человека.
Предназначение классических ПЦР лабораторий
Сотрудники данного типа лабораторий занимаются научной экспериментальной деятельностью и проводят анализы биоматериала. Получаемые ими результаты востребованы в криминалистике, генной инженерии, процедурах установления отцовства и так далее. Кроме того, применяемые методики позволяют сделать медицину более избирательной, учитывать аллергические реакции организма, непереносимость им каких-либо лекарственных препаратов. С их помощью возможно на ранних этапах развития выявлять происходящие мутации различных инфекций. При помощи ПЦР-исследования появляется возможность диагностирования заболеваний в случаях, когда никаких видимых признаков недуга нет. Преимуществом данного типа исследований выступает высокая точность при минимальных рисках ошибки.
Рабочие зоны в лаборатории
С учетом проведения поэтапности исследований ДНК, рабочее пространство лаборатории должно быть разделено на несколько специализированных зон:
- Зона приемки, размещения и маркирования биологических материалов, поступающих для исследования.
- Зона выделения ДНК/РНК, изолированная от других пространств, и используемая только в интересах ПЦР-исследований.
- Зона проведения полимерных цепных реакций и приготовления химических реактивов, отделенная от других пространств лаборатории.
- Зона детекции продуктов амплификации, получаемых посредством гибридизационного анализа или электрофореза.
Последняя зона не требуется лаборатории в случаях, когда она пользуется технологиями real-time PCR.
Отдельно требуется выделение помещения под архив, организацию отдыха персонала, раздевалки, кабинеты административного персонала, туалетные комнаты и иные помещения вспомогательного назначения. Целесообразно также наличие отдельного бокса, в котором поступающие материалы проходят процедуру дезинфекции.
Обязательным условием функционирования любой лаборатории является ее подключение ко всем инженерным коммуникациям (водопровод, отопление, электроснабжение, водоотведение, принудительная вентиляция и так далее). Должны соблюдаться требования и нормативы пожарной безопасности, а зона детекции должна быть изолирована от других помещений, имеющихся в лаборатории.
Выбираемые для отделки пола, стен и потолков покрытия должны обеспечивать наличие гладкой поверхности без стыков и швов, иметь невосприимчивость к моющим и дезинфицирующим средствам, применяемым в лабораторных условиях для поддержания санитарного порядка. Для рабочих зон предусматривается монтаж бактерицидных обеззараживающих ламп.
Необходимая лабораторная техника
Чтобы ПЦР лаборатория смогла полноценно функционировать, она должна быть оснащена полным комплектом необходимого оборудования, среди которого:
- аплификатор;
- насос, оснащенный улавливающей колбой;
- термостат для пробирок;
- бокс настольный для осуществления полимерных цепных реакций;
- вортекс (центрифуга для исследуемых материалов);
- аппарат для проведения электрофореза;
- трансиллюминатор;
- считыватель данных на ДНК-чипах;
- камера на биомикрочипах;
- холодильными;
- оборудование для ПЦР анализа в реальном времени.
Среди обязательных систем, необходимых для полноценного функционирования лабораторий, необходимо выделить. Гель-электрофорез, позволяющий отображать полученные результаты проводимых исследований, и гель-документацию для проведения анализа полученных данных.
Требуется и оснащение соответствующей мебелью, соответствующей нормативам обеспечения лабораторных помещений. В их числе лабораторные столы и стулья, шкафы, навесные полки, тумбы. От нее требуется надежность, удобство, невосприимчивость к химическим веществам, гладкость поверхностей для простоты уборки, устойчивость к износу. В большинстве случай выбор делается в пользу моделей, обладающих простыми и одновременно эргономичными формами.
Оборудование для ПЦР лабораторий
Группа компаний UED является крупным поставщиком лабораторной мебели и оборудования на территории России и стран постсоветского пространства. Будучи поставщиком только качественной продукции, отвечающей самым строгим стандартам, мы готовы взять на себя ответственность по полному оснащению ПЦР лаборатории для полноценной и эффективной работы.
ТРЕБОВАНИЯ К ПЦР-ЛАБОРАТОРИИ
А.1 Лаборатория должна быть разделена на зоны (отдельные комнаты или помещения) для каждой из стадий ПЦР-диагностики.
А.2 Рабочая зона ПЦР-лаборатории в соответствии с этапами ПЦР-испытания должна включать следующий минимальный набор изолированных помещений:
— приема и регистрации лабораторной пробы;
— первичной обработки лабораторной пробы, подготовки анализируемой пробы (I зона, отдельный ламинар);
— выделения НК из анализируемой пробы (I зона, отдельный ламинар).
Примечание — Помещения, где проводят работы по выделению и амплификации НК, располагают как можно дальше от помещения для детекции и учета результатов ПЦР с целью исключения движения воздушного потока и предотвращения контаминации продуктами амплификации (ампликонов), поскольку в процессе ПЦР фрагменты ДНК накапливаются в огромных количествах и являются идеальными продуктами для реамплификации;
— приготовления реакционных смесей, постановки ПЦР (II зона);
— гибридизационно-флюоресцентной детекции и учета результатов испытания методом Real Time PCR (III зона).
Рисунок А.1 — Схема ПЦР-лаборатории
А.3 Работа в ПЦР-лаборатории должна быть организована в одном направлении: от зон выделения и амплификации НК к зоне детекции и учета результатов ПЦР. В разных зонах лаборатории должны работать разные сотрудники.
А.4 Не допускается выполнение ПЦР-испытаний в помещениях для проведения работ другими лабораторными и генно-инженерными методами (клонирование, секвенирование, рестрикционный анализ).
Все работы по подготовке испытуемых проб и выделению НК проводят в ламинарном боксе II, III классов защиты.
А.5 Каждая рабочая зона должна иметь свой набор лабораторной мебели, оборудования, реагентов, автоматических пипеток, расходных материалов, лабораторной посуды, защитной одежды, обуви, уборочного инвентаря и др. Имущество должно иметь маркировку, использование его в других помещениях или для проведения других работ запрещено.
А.6 Для проведения ПЦР-испытаний необходимо использовать только одноразовые микропробирки и наконечники. Для предотвращения аэрозольного загрязнения автоматических пипеток используют наконечники с антиаэрозольным фильтром. Пробирки и наконечники для автоматических пипеток используют однократно. При переходе от одной пробы к другой обязательно меняют наконечники с целью предотвращения перекрестной контаминации в процессе выделения ДНК, РНК или при раскапывании реакционной смеси.
А.7 Работы по подготовке реакционной смеси для ПЦР, внесению выделенных НК в ПЦР-смесь проводят в ПЦР-боксах, оснащенных ультрафиолетовыми лампами.
Регулярно следует проводить мониторинг помещений, оборудования, рабочих поверхностей, дверных ручек на наличие продуктов амплификации.
Скачать документ целиком в формате PDF
Существует несколько методов определения ПЦР:
- полимерная цепная реакция с электрофоретической детекцией — самый известный, классический метод;
- ПЦР в режиме реального времени;
- ПЦР с флуоресцентной детекцией по «конечной точке» — FLASH-метод.
Есть и другие методы, но они менее распространены.
Каждый метод имеет область применения и некоторые ограничения. Кроме того, для каждого метода нужны свои приборы, и они могут заметно отличаться по стоимости, требованиям к помещению и квалификации специалистов.
Как показала практика, оптимальным по соотношению универсальности, производительности и стоимости является метод определения ПЦР в режиме реального времени. Он подходит для стационарных и мобильных лабораторий разного типа — от клинико-диагностических до судебно-медицинских. Кроме того, метод ПЦР в режиме реального времени подходит для определения ГМО. Цена ПЦР-лаборатории под ключ составляет меньше 4 миллионов рублей, а если у вас уже есть свободные ламинарные боксы, термостаты и другие оборудование, цена может быть существенно меньше. Самое дорогое оборудование — собственно амплификатор и детектор в одном корпусе — стоит около 2,5 миллионов рублей.
Сейчас практически все пациенты и медицинский персонал должны обследоваться на COVID-19, при этом важно отличить коронавирусное поражение от других инфекционных и неинфекционных болезней. Поэтому значение ПЦР-метода возросло, ведь такие исследования являются золотым стандартом диагностики многих инфекционных заболеваний. Это один из самых быстрых, специфичных и чувствительных способов выявить этиологический агент инфекции, а значит, и возможность вовремя назначить подходящее лечение пациенту.
В статье мы подскажем, как организовать ПЦР-лабораторию и безопасно проводить ПЦР-диагностику на ее базе. Вы узнаете, какие требования предъявляются к таким лабораториям, что вам нужно обязательно предусмотреть при их проектировании и открытии, получите пакет необходимых документов.
Лучше всего размещать ПЦР-лабораторию в отдельно стоящем корпусе или части здания, изолированной от других подразделений медицинской организации.
Если соблюсти такие условия невозможно, то на базе уже действующей лаборатории выделите специальный блок для ПЦР-исследований. При этом в блоке организуйте самостоятельные рабочие зоны, которые соответствуют:
- этапам выполнения диагностических работ;
- поточности движения персонала;
- поточности материалов, содержащих патогенные биологические агенты (далее — ПБА).
КАКИЕ РАБОЧИЕ ЗОНЫ ДОЛЖНЫ БЫТЬ В ПЦР-ЛАБОРАТОРИИ?
Все помещения для ПЦР-диагностики должны быть боксированными, промаркируйте и пронумеруйте их в соответствии с этапами исследований.
В ПЦР-лаборатории выделите «заразную» и «чистую» зоны.
Требования к отделке помещений
Для ПЦР-лаборатории выбирайте отделочные материалы, мебель и оборудование, устойчивые к мытью, обработке дезинфицирующими средствами и ультрафиолетовым облучением.
Для стен и пола используйте кафельную плитку (предпочтительно).
Все поверхности должны быть гладкими, без трещин или щелей.
На окна поставьте надежные запирающие устройства. Можете использовать светозащитные пленки из материалов, устойчивых к дезинфектантам.
Устанавливать жалюзи нельзя — они адсорбируют пыль.
Каждое рабочее помещение оборудуйте водопроводом, канализацией, электричеством, отоплением, средствами пожаротушения, естественным и искусственным освещением, а также приточно-вытяжной вентиляцией.
Требования к оборудованию
Проверьте себя по чек-листу.
Требования к вентиляции и обеззараживанию воздуха
Требования к вентиляции представлены на схеме 2. Допустима установка кондиционеров, но при условии их выключения на время проведения работ с использованием методов амплификации нуклеиновых кислот и последующей дезинфекции рабочих мест, ежемесячной дезинфекции оборудования и замены фильтров.
Требования к боксам биологической безопасности
Различают боксы трех классов (см. схему 3).
В рабочих зонах 1 и 2 все манипуляции с материалами, которые могут содержать ПБА, включая процедуры с риском образования аэрозолей, выполняйте в боксах биологической безопасности классов II или III.
В зонах 3, 4-1 и 4-2 используйте боксы биологической безопасности классов I и II либо ПЦР-боксы.
При работе с материалом, содержащим микроорганизмы III-IV групп патогенности, этапы анализа, выполняемые в рабочих зонах 4-1 и 4-2, проводите на лабораторных столах.
Е. В. Дубель, кандидат медицинских наук, врач-эпидемиолог, врач-дезинфектолог,
И. А. Лебедева, заведующий КДЛ БУЗ ВО «Вологодский противотуберкулезный диспансер»
Материал публикуется частично. Полностью его можно прочитать в журнале «Санэпидконтроль. Охрана труда» № 6, 2020.
Принципиальная схема размещения ПЦР-лаборатории
Обозначения:
- Зона приема, разбора и первичной обработки материала;
- Зона подготовки проб и выделения НК;
- Зона приготовления реакционных смесей, проведения ОТ и ПЦР;
- Зона детекции результатов методом электрофореза и ГиФА;
- Комната анализа результатов;
- Предбокс;
- Комната обеззараживания материала;
Похожие статьи:
Примите к сведению
Информация на этом сайте представлена в справочных и образовательных целях и не должна быть использована как инструкция по лечению. В любых случаях необходимо консультироваться у врача.